在ISCC下，有不同的选择来确定同时共处理的生物产品的份额，这些都考虑到了生物和化石输入和过程的差异。

    任何实际的温室气体计算都应按照ISCC205的方法进行。燃料生产过程中生产一种或多种产品的，温室气体排放应当分为燃料或者其中间产品与副产品1与其能量含量成比例（由电力以外的共产品的较低的加热值决定）。

    ISCC质量平衡应严格对加工单位存储措施要求：

    1、供应商和信用接受者必须是同一公司/公司集团/合资企业的一部分

    2、地点必须位于国家边界内或邻国内（共享内陆边界）

    3、仅适用于同类产品

    4、质量平衡必须保持现场特定

    5、所有站点必须具备ISCC认证

    6、证书必须由同一认证机构签发

    ISCCEU系统文件204“审计要求和风险管理”涵盖了如何在供应链的不同要素进行ISCC审计的要求、ISCC下适用于ISCC所有活动的风险管理过程以及风险对ISCC审计的影响。

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